Samostatné chirurgické oddělení vzniklo v roce 2006 sloučením Vojenské nemocnice a  Fakultní nemocnice Plzeň. V současnosti poskytuje nepřetržitou ambulantní a nemocniční péči pro pacienty s chirurgickými, traumatologickými a ortopedickými chorobami. Ročně je zde hospitalizováno asi 4000 pacientů, provedeno přes 3200 operačních zákroků a ambulantně ošetřeno více jak 35 tisíc nemocných.